Человечество едва избежало исчезновения под натиском коварных задумок доктора Хелла и его подпольной империи. Кодзи Кабуто вместе с величественным роботом Мазингер Зет и друзьями из лаборатории фотонной энергетики решили покончить с темными планами учёного и вернуть миру мир и спокойствие. Прошло уже десять лет; он идёт по пути учёного, продолжая семейную традицию, унаследованную от отца и деда. Вскоре на него обрушивается встреча с загадочной формой жизни, захороненной глубоко под горой Фудзи, и это открытие переворачивает всю его судьбу. Новые события, новые угрозы и новая судьба ждут человечество. Опытный герой вынужден принять решение, которое определит исход будущего: Бог или Дьявол? В очередной раз будущее доверено Мазингеру Зет.
