Стальная тревога! Новый рейд

События аниме Стальная тревога! Новый рейд, вышедшего в 2005 году, разворачиваются через два месяца после инцидента на подводной лодке «Туата Де Дананн», завершившего первый сезон. Мир героев вновь сталкивается с необычными тайнами: Мифрил обнаруживает существование скрытой организации, владеющей технологией, способной вскрывать ECS — систему электронных замков. Эта сила действует под вывеской Амальгама и помимо прочего обладает загадочным «темным» ноу-хау, заимствованным у некоего «виспера», близкого к Канаме Тидори. Как и прочие секретные агентства, Амальгама упорно идёт к своей цели, не собираясь останавливаться на достигнутом. Уже в момент, когда миссия Сосукэ Сагары по охране Тидори отзывается Мифрилом, все элементы замысла Амальгамы становятся на свои места, а противостояние обостряется. Глубинная заговорами скрытая сеть сил вынуждает героев пересмотреть свои планы и бороться с темной стороной, чьи амбиции грозят перевернуть ход событий.