Описание
В 2012 году Япония столкнулась с вторжением Мю — гуманоидных существ с голубой кровью, прибывших из иного измерения. К 2015 году захватчики обрушиваются на Токио, но их наступление отступает под давлением загадочного оружия, именуемого «долем». В этом хаосе Аято Камина встречает свою одноклассницу Рэйку Мисиму. В тот же день против него выступают представители правительства, но на помощь приходит женщина Харука Сито, утверждающая, что её послала организация «TERRA», и сообщает, что Токио запечатан во временном разрыве, где время идёт лишь в трети обычной скорости. Аято прячется от Харуки и тайком запрыгивает на поезд, где вновь встречает Рэйку. Приехав в Зал Ра, он следует за ней к ужасающему гигантскому яйцу, из которого вылупился долем Ра-Зефон (RahXephon). Внезапно на вершине долема появляется мать Аято, обезоруживая вторжение «TERRA»; увидев её голубую кровь, Аято и Харука вынуждены бежать, спасаясь от катастрофы.