История разворачивается в городе Кивотос, где тысячи учебных заведений держат город под плотным контролем Генерального студенческого совета. Прекрасным утром произошла пропажа президента совета, и хаос стремительно охватил город. Чтобы вернуть порядок, Совет обращается к Федеральному бюро расследований S.C.H.A.L.E., учреждённому ещё до исчезновения президентом. Взять на себя непростую роль восстановителя — задача предстоит таинственному учителю, который недавно появился в городе по поручению президента. Став руководителем S.C.H.A.L.E., он получает первое задание: охранять академию Абидос и не допустить её закрытия. Сможет ли Сэнсэй в сотрудничестве с учениками преодолеть надвигающиеся трудности, спасти учебное заведение и раскрыть темные тайны родного города? Ему предстоит объединить разрознённых учеников разных академий, чтобы противостоять скрытым угрозам и политическим интригам, которые ставят под угрозу мир города.
