События разворачиваются в далёком будущем, где передовые технологии переплелись с повседневной жизнью и даже сами дуэльные схватки на карты стали частью этой реальности. Главный герой Юма Цукумо мечтает стать чемпионом турнира «Дуэль Монстров», но пока он лишь новичок без отточенной тактики и стратегии. Однажды он бросает вызов местному чемпиону Камисиро Рёге, и в момент дуэли рядом у него появляется загадочный призрак без воспоминаний — Астрал. Он рассказывает, что его память расколота на девяносто девять невиданных карт, получивших название «Номера». Теперь цель Юмы насыщается не только стремлением подняться к вершинам мира дуэлей, но и помощью странному призраку вернуть утраченное сознание. По мере развития истории юноша понимает новые правила и связи между силами духов и карточек, и его дорога к славе превращается в путь самоопознавания, дружбы и хитрой тактики.
