Смотреть Аниме «Призрак в доспехах: Вознесение — Призрачная боль»

События разворачиваются в 2027 году, год после завершения неядерной войны. Нью-Порт-Сити постепенно восстанавливается, однако над ним снова нависла угроза: город подвергается ударам автономных мин, выпущенных как будто по расписанию, что приводит к новым разрушениям и расследованию. В это же время становится известно, что военный чиновник, замешанный в взятках и продаже оружия, был застрелен. В ходе расследования глава отдела общественной безопасности Дайсуке Арамаки сталкивается с Мотоко Кусанаги, которая предназначена в 501-й секретный отдел. Бато подозревает, что Кусанаги может быть причастна к недавно произошедшим инцидентам, учитывая, что она не пострадала во время взрыва. Детектив префектуры Ниихама Тогуса расследует два дела об убийстве. Меж тем Мотоко находится под непрерывным наблюдением со стороны руководителя 501-го секретного отдела и агентов-киборгов, что добавляет напряжения в её уже сложные отношения с силовыми структурами.