Десятилетие спустя после того, как Нагатэ Таникадзэ сумел отразить атаку Гауна и спасти «Сидонию» — последний бастион человечества в безграничном космосе — на борту снова наступает относительное спокойствие. Жители корабля наслаждаются редким ощущением мира и стабильною безопасностью повседневной жизни, которая казалась недосягаемой ранее. Но для Цумуги Сирауи этот покой оборачивается растущей привязанностью: она всё яснее осознаёт, что её чувства к Нагатэ становятся сильнее, чем просто восхищение героем. В то же время капитан Кобаяси неустанно напоминает, что пока где‑то в бескрайних просторах Вселенной живут Гауна, миру нельзя доверять полностью. Впереди — решающая схватка, последняя битва, от которой зависит выживание всего человечества. Смогут ли рыцари «Сидонии» противостоять надвигающемуся злу и защитить своих близких, сохранив любовь на фоне финального испытания?
