Во второй фильм Нелюдь: Столкновение зрителю повторно показывают развязку сюжета последних семи серий первого сезона и стартовую сцену второго. Кэй Нагай, наконец, вырвавшийся из лабиринтов лаборатории Комитета по контролю над нелюдьми, находит укромное место, где можно перевести дух и обдумать дальнейшие шаги. В это время на экране появляется Сато: он открыто требует от правительства признания прав нелюдей и грозит применить серию жестких действий против человечества, если требования останутся несбыточными. В предстоящем противостоянии ставки зашкаливают: с одной стороны — безопасность Кея и его близких, с другой — идеология и опасные планы оппозиции. Под давлением реальности и этических дилемм герой вынужден сделать выбор: присоединиться к попытке остановить Сато и предотвратить катастрофу или продолжать бегство, ища ещё одно место, где можно спрятаться от нагнетаемой напряжённости. В фильме поднимаются вопросы власти, свободы и цены, которую нужно заплатить за выживание в мире, где нелюди становятся ключом к будущему.
