События разворачиваются на современном боевом корабле японских сил самообороны, оснащённом системой «Эгида». На палубе обнаруживают тело военнослужащего, у которого отсутствует левая рука, что добавляет зловещей загадочности делу. Вскоре поступает тревожная информация: на борт мог проникнуть коварный шпион под кодовым именем «X», чья цель — подорвать безопасность страны. Но предполагаемая операция злоумышленника ещё далека от успеха: расследование сталкивается с хитроумными уловками и запутанными следами, которые тянут время и сбивают с толку команду. Именно в такой критический момент на арену выходит легендарный детектив Конан Эдогава — юный мастер логики, способный распутывать самые запутанные заговора, защищать близких и задерживать виновных. Его острый ум, терпение и невероятная внимательность к деталям ставят под сомнение любую ложь, и он намерен довести расследование до конца, даже если море грозит поглотить всё вокруг.
